Родился он 6 октября 1935 г. в с. Мургук Сергокалинского района в крестьянской семье Исраповых Мусы и Муслимат. Отец геройски погиб в Великую Отечественную войну, детей воспитала мать. В тяжелейших условиях мужественная горянка сумела достойно наставить на жизненный путь троих детей, дать им высшее образование.
После окончания Мургукской неполной средней школы Магомед-Саид продолжил учебу в Сергокалинском педагогическом училище, работал сельским учителем в родном районе. Затем тяга к знаниям привела его в Дагестанский государственный университет. По окончании вуза продолжил учебу в Москве, в аспирантуре Института языкознания АН СССР, защитил кандидатскую диссертацию на тему «Лексика даргинских диалектов в сравнительно-историческом освещении». Докторскую диссертацию на тему «История словоизменительных категорий даргинского языка» также защитил в Москве, в Институте языкознания РАН, в 1989 году.
С 1960 года Мусаев связал свою судьбу с Дагестанским государственным университетом, где прошел путь от ассистента кафедры дагестанских языков до ее заведующего.
Многогранен и широк круг вопросов, которым ученый посвятил свыше 60 лет своей научно-педагогической деятельности. Им опубликовано свыше 200 научных работ, в числе которых десятки монографий, где рассматриваются проблемы всех уровней языка. Он автор учебников, учебных и методических пособий, программ по даргинскому языку и литературе для школ республики (всего 17 изданий) и учебника даргинского языка для педучилищ, многократно переизданных.
Учебники Мусаева отличаются тем, что в них отражаются современные научные знания, представлены межпредметные и внутрипредметные связи, они снабжены дополнительным и вспомогательным материалом, который способствует развитию познавательного интереса учащихся. А это, в свою очередь, позволяет учителю применять индивидуальный подход к учащимся в зависимости от их интеллектуальных и психофизических возможностей. В учебнике по даргинскому языку для 5 класса в приложении представлен «Мини-толковый словарь даргинского языка». Это высоко оценили учителя родного языка. Учебники Магомед-Саида Мусаевича выгодно отличаются в научном и методическом плане, поэтому педагогическая общественность республики положительно отзывается о них.
До выхода на пенсию профессор Мусаев читал в ДГУ лекции и вёл практические занятия по курсам «История даргинского языка», «Современный даргинский язык», «Диалектология даргинского языка», «Сравнительная грамматика дагестанских языков», «Введение в кавказоведение», а также спецкурсы «Система словоизменения даргинского языка», «История лексикологии даргинского языка». Он также руководил курсовыми и дипломными работами, многократно возглавлял летние научно-студенческие экспедиции по сбору фольклорного и диалектного материала даргинского языка, руководил факультетской педагогической практикой по родным языкам и литературам.
В его научных работах тонкий лингвистический анализ сочетается с глубоким теоретическим обобщением. Почти по каждому вопросу исследователь имеет свое оригинальное и научно обоснованное мнение. Его серьезное отношение к делу, дотошность и внимание к мельчайшим деталям достойны подражания. Мусаев первым из кавказоведов высказал мнение об истории развития сложной временной системы даргинского языка. Сравнительный анализ фактов многочисленных диалектов дало ему обоснование заявить о своём уникальном предложении по этому вопросу.
Профессор Мусаев часто выступал с интересными научными сообщениями на международных, всероссийских, региональных и вузовских научных конференциях. Большую научную работу проводил в качестве редактора, рецензента различных сборников и монографий, посвященных изучению даргинского и других дагестанских языков. Систематически оппонировал кандидатские и докторские диссертации, успешно руководил аспирантами и соискателями. Основал научную школу «Синхронное и диахроническое изучение дагестанских языков».
Научные интересы профессора, однако, не ограничивались рамками только даргинского языка. Он внёс определённый вклад в изучение даргинского фольклора и литературы: составил и издал два сборника даргинских народных песен и сказок; написал ряд статей, посвящённых фольклору и творчеству отдельных писателей. А.Ф. Назаревич в книге «В мире горской народной сказки» написал такие строки: «Эти такие трудолюбцы, как Иса Омаров и Расул Багомедов, которые вместе с выпускниками Магомед-Саидом Мусаевым и Альбури Абдусаламовым за одно только лето 1959 г. собрали даргинских народных сказок больше, чем их было собрано за всё время существования дагестанской фольклористики».
Профессор М.-С. М. Мусаев систематически интересовался проблемами функционирования дагестанских языков, языковой ситуацией в Дагестане и языковой политикой, которую необходимо проводить в многоязычной республике.
Научные успехи Мусаева достойно и высоко оценены республикой. За большие научные успехи ему присвоены вышеназванные почетные звания. Он ветеран труда, награждён Почетной грамотой РД, именными часами Главы РД и главы администрации г. Махачкалы, а также дипломом Нобелевского комитета при королевстве Швеция. Плодотворная научная, научно-организационная, учебно-педагогическая и общественная деятельность ученого-языковеда послужила основанием для избрания его в 1997 году действительным членом (академиком) Международной академии наук высшей школы.
Оценивая жизненный и творческий путь своего коллеги, профессор ДГУ
А. А. Абдусаламов написал следующее: «Научные склонности М.-С. Мусаева проявились с увлечения сбором даргинского фольклора под руководством А. Ф. Назаревича. Это увлечение стало делом всей его жизни. Любовь к исследованию языка у него фанатична, успехи – налицо. Зная прожитую им жизнь, могу, не кривя душой, назвать её подвигом для нынешней молодёжи, стремящейся связать свою жизнь с наукой, путь М.-С. Мусаева – это поучительный пример».